La necrosis gástrica puede afectar de forma diferencial a los componentes (mucosa, submucosa, muscular y serosa) del estómago. La necrosis del epitelio de las glándulas gástricas es una condición asociada a patologías infecciosas y no infecciosas. La necrosis de las glándulas gástricas se caracteriza por dilatación del lumen, disminución de la altura del epitelio y pérdida de la estructura del epitelio glandular.

En lo peces el epitelio branquial constituye una barrera física, inmunológica y bioquímica entre el pez y su medio ambiente. Entre las células que componen el epitelio branquial se encuentran las células mucosas. La proliferación de las células mucosas es una de la respuesta inicial de la branquia a irritantes exógenos, lo cual trae como resultado un incremento en el mucus, siendo de esta forma un indicador de la salud branquial.

La esteatosis muscular es una condición caracterizada por el reemplazo de la musculatura esquelética por tejido adiposo. Macroscópicamente los peces afectados presentan tejido graso infiltrando la musculatura esquelética. Entre los hallazgos relevantes se observa el reemplazo del tejido muscular esquelético por tejido adiposo. De forma variables esta condición se asocia a atrofia y degeneración de las fibras musculares. 

Entre los oomycetes patógenos de animales se encuentra las especies pertenecientes al género Saprolegnia sp., que afectan a todas las especies de salmónidos en cultivo en la fase de agua dulce, produciendo impacto en términos de mortalidad, welfare animal, predisposición a infecciones secundarias y calidad de smolt. Los peces afectados se caracterizan por la presencia de lesiones cutáneas tales como erosiones, úlceras y hemorragias, asociadas al crecimiento de micelios que presentan una morfología similar “algodón”, localizados la cabeza, aleta adiposa y aleta caudal. En el caso particular de las ovas se observa un crecimiento de los micelios que puede afectar toda la superficie.

Los melanomacrófagos (MM) son células fagocíticas con altas cantidades de melanina, lipofuscina y hemosiderina y están presentes en varias especies de sangre fría, incluido los peces. Los melanomacrófagos desempeñan funciones duales, participando en la respuesta inmune y procesos fisiológicos normales y anormales. La infiltración de melanomacrófagos en el tejido branquial se ha asociado a diferentes patologías. En la fase de agua dulce se asocia a exposición subaguda a crónica a condiciones ambientales desfavorables, en la fase de agua de mar se ha observado asociado a la enfermedad branquial.

Los uréteres o conductos arquinéfricos, conducen la orina desde los conductos colectores a la papila urinaria, pueden fusionarse en cualquier nivel y puede dilatarse, después de la fusión, para formar una vejiga. Los conductos urinarios se abren hacia el exterior posterior al ano. Las alteraciones de los uréteres son escasas y en general se relacionan a patología obstructivas.

La Furunculosis atípica es una infección bacteriana sistémica, causada por Aeromonas salmonicida atípica. En Chile la infección fue reportada por primera vez en el año 1995, en un centro de cultivo en centro estuarino cercano a la ciudad de Puerto Montt, X región afectado a Salmon del Atlántico (Salmo salar). Los últimos años, 2021 y 2022, se ha observado un incremento de casos en pisciculturas con mortalidades variables, en alevines y smolt de Salmón del Atlántico (Salmo salar).En los cuadros crónicos predominan las lesiones cutáneas predominantemente ulcerativas, las cuales presentan infección masiva de bacterias afectando la piel, musculatura roja y de forma variable se extienden a la musculatura roja.

La fibrosis renal, caracterizada por la fibrosis tubulointersticial y glomeruloesclerosis, corresponde a la manifestación final de la enfermedad renal crónica y se caracteriza por un exceso de depósito de matriz extracelular. En salmónidos la nefropatía obstructiva asociada a nefro calcinosis producto de la exposición crónica a niveles de CO₂ sobre los parámetros considerados como normales, es una de las patologías asociadas a fibrosis renal. 

La miocitólisis focal (también conocida como "degeneración vacuolar" y "miocitólisis colicuativa") del corazón se caracteriza por la vacuolización gradual de las fibras musculares. Se ha sugerido que la lesión produce muerte celular y cicatrización. Esta patología ha sido asociada a enfermedad isquémica agua y crónica, cardiomiopatías, miocarditis, endocarditis entre otras. Particularmente en Salmón del Atlántico (Salmo salar), se ha observado ocasionalmente en peces que cursan cuadros de Inflamación del músculo esquelético y cardiaco (HSMI), no habiendo aun datos suficientes para determinar esta correlación. 

La inflamación granulomatosa es un tipo definido de inflamación crónica que se encuentra en una serie limitada de procesos infecciosos y no infecciosos. La inflamación granulomatosa es un tipo definido de inflamación crónica que se encuentra en una serie limitada de procesos infecciosos y no infecciosos. Salmón del Atlántico (Salmo salar), presentaron lesiones en la base de la aleta caudal, de tamaño variable, pigmentadas de color negro con zonas de color gris, forma irregular y consistencia firme. Histopatológicamente los hallazgos histopatológicos son consistentes con dermatitis granulomatosa.

Furunculosis atípica es una infección bacteriana sistémica, causada por Aeromonas salmonicida atípica, la cual ha sido descrita en una amplia variedad de especies de cultivo y se distribuye ampliamente a nivel mundial. El año 2021 y 2022 se ha observado un incremento de casos en pisciculturas con mortalidades variables, en alevines y smolt de Salmón del Atlántico (S. salar). Histopatológicamente l,os peces afectados presentan de forma variables colonias de bacterias remplazando el tejido, con escasa reacción inflamatoria.

El daño tubular aguade es una condición renal que se presenta como resultado de un insulto isquémico o tóxico que afecta la función y morfología de los túbulos renales. Entre los cambios morfológicos asociados a lesión tubular se encuentran degeneración vacuolar del epitelio tubular, disminución de la altura del epitelio tubular, dilatación tubular, necrosis del epitelio tubular, pérdida del borde en cepillo de los túbulos contorneados proximales.

El cristalino es una estructura transparente en forma de lente, siendo a la segunda estructura refractante del ojo. Se encuentra conformado por una cápsula, un epitelio cúbico y las fibras del cristalino. La catarata es un término amplio para referirse a cualquier opacidad parcial o total del cristalino, lo cual trae como consecuencia una disminución o pérdida de la visión. Entre los hallazgos morfológicos histopatológicos relevantes se encuentran la hiperplasia del epitelio del cristalino, degeneración y necrosis de las fibras del cristalino, presencia de células vejiga y cuerpos de Morgagni.

La hemosiderosis hepática es la acumulación de hemosiderina en los hepatocitos, lo cual representa un hallazgo morfológico más que una enfermedad específica. El hierro puede acumularse en el hígado asociado a una variedad de condiciones incluyendo causas congénitas, sistémicas asociada a concentración de hierro (hemocromatosis hereditaria), condiciones asociadas con la acumulación sistémica de hierro (condiciones hemolíticas, anemia por enfermedad crónica, etc.) y hepatitis, entre otras causas. 

Los melanomas constituyen un tipo de neoplasia de las células denominadas melanocitos (células que producen melanina). La gran mayoría afecta a la piel, aunque también aparecen en las superficies mucosas oral, anogenital, esófago, meninges y ojo. El melanoma maligno es la tumoración con mayor afinidad por el tejido cardíaco durante su diseminación metastásica. El espécimen afectado presento macroscópicamente una pigmentación de color negro difusa que afecta predominantemente a los ventrículos. Histopatológicamente se observa densa proliferación de melanocitos pigmentados que invaden el tejido cardiaco incluyendo la capa compacta y esponjosa. En algunas áreas formando agregados con forma de nodulares.

El estómago es una parte clave del tracto gastrointestinal (GI), ubicado entre el esófago y el intestino proximal. La secreción de jugos en el estómago de mamíferos corre a cargo de células especializadas de su pared, la llamada mucosa gástrica. Los cambios morfológicos gástricos generalmente no son estudiados o parte del diagnóstico rutinario, ya que es un órgano que no es frecuentemente considerado en los muestreos, sin embargo, en ocasiones constituyen un elemento fundamental para explicar ciertas condiciones sanitarias y estado productivo de los peces. 

El músculo esquelético se encuentra constituido por miofibrillas, la parte contráctil del músculo, tejido conectivo o matriz extracelular (ECM), los capilares sanguíneos y los nervios que irrigan el músculo. La fibrosis del músculo esquelético puede ser un problema clínico devastador que surge de muchas causas, incluidas las enfermedades primarias del tejido muscular esquelético, como se observa en las distrofias musculares, o puede ser secundaria a eventos que incluyen traumatismo muscular o lesión cerebral.

La Septicemia rickettsial salmonídea (SRS) o Piscirickettsiosis, es una enfermedad infecciosa bacteriana causada por Piscirickettsia salmonis. Entre los hallazgos histopatológicos que pueden ser observados en el riñón se encuentran la necrosis difusa del tejido hematopoyético y edema, asociado a infiltrado inflamatorio mononuclear y la presencia de estructuras cocoides basófilas intracelulares consistentes con Piscirickettsia salmonis en el tejido hematopoyético y macrófagos.

El término hialino suele aludir a una alteración dentro de las células o en el espacio extracelular que les da un aspecto homogéneo rosado y vítreo en los cortes rutinarios de histología teñidos con hematoxilina y eosina. Estas son entidades morfológicas inespecíficas que se encuentran en una variedad de lesiones que van desde lesiones normales a no neoplásicas a neoplásicas, pudiendo ser  intracelulares o extracelulares.

Las infecciones por Loma salmonae afectan principalmente a especies de salmón y trucha pertenecientes al género Oncorhynchus sp., tanto en agua dulce como salada. El parásito infecta la pared de los vasos sanguíneos de varios órganos, pero las branquias son el sitio principal de infección. La infección inicial ocurre en el intestino y los xenomas se detectan fácilmente en las branquias mediante histología estándar a las 4-6 semanas posteriores a la exposición.