La melanosis muscular es una condición que afecta al Salmón del Atlántico (Salmo salar), manifestándose con diversas distribuciones y formas, y se caracteriza por una pigmentación que va desde el gris hasta el negro en la musculatura. La pigmentación negra es el resultado de la acumulación de melanomacrófagos, células que contienen melanina. La melanosis muscular se manifiesta clínicamente a través de una pigmentación que varía en tonalidad, desde el gris hasta el negro, en la musculatura. La presencia de melanosis subclínica puede ser observada en cortes histológicos de musculatura, de preferencia utilizando tinciones para la detección de melanina.

La vejiga natatoria es un órgano sacular, lleno de gas localizado en la porción superior de la cavidad abdominal, entre las vísceras y el riñón. Una de las manifestaciones visibles de la inflamación de la vejiga natatoria (saculitis aérea), es cambio en su coloración de un aspecto transparente, brillante a una coloración opaca grisácea, además puede observarse un engrosamiento de su pared y la presencia de hemorragias petequiales.

La piel posee una capacidad notable para repararse a sí misma cuando sufre daños. Cuando la piel experimenta traumas o lesiones, se desencadena un proceso complejo y delicado conocido como patología de la reparación cutánea o cicatrización de heridas. Las lesiones de las células y tejidos activan una serie de acontecimientos que contienen el daño e inician el proceso de cicatrización. Este proceso se puede separar de forma amplia en regeneración y reparación.

Peliosis hepatis es una condición patológica caracterizada por la presencia de espacios o cavidades llenos de sangre en el parénquima hepático. Estos quistes o cavidades interrumpen la arquitectura normal del tejido hepático y pueden estar asociados con la necrosis del tejido hepático.  Entre las patologías en las cuales se presenta la peliosis hepatis se encuentra la Anemia infecciosa del salmón (ISA), Síndrome hemorrágico del smolt (SHS) y menos frecuente en casos de Inflamación del músculo esquelético y cardiaco (HSMI).

La ruptura auricular es un evento patológico severo asociado a patologías cardiacas, que conduce inevitablemente a la muerte. Los peces afectados presentan una dilatación auricular, hemopericardio y flacidez en la pared auricular. Entre las causas asociadas a esta condición se encuentran las infecciones virales, específicamente por Piscine orthoreovirus (PRV) y patologías cardiacas no infecciosas.  Los peces afectados presentan vacuolización, degeneración y ruptura de las fibras del miocardio de la aurícula. Los espacios se encuentran pletóricos de eritrocitos.

La piel es un órgano complejo, el más grande del cuerpo, en el que interacciones celulares y moleculares regulan respuestas cruciales en a nuestro entorno. La estructura de la piel varía en cierta medida entre las especies, pero está básicamente compuesta la epidermis externa, dermis subyacente y la hipodermis. La dermatitis bacteriana es una inflamación de la piel, asociada entre otras causas a infecciones bacterianas por Piscirickettsia salmonis, agente etiológico de la Septicemia rickettsial salmonidea (SRS).

Osteoma cutis o la osificación cutánea es una patología caracterizada por la formación de hueso en la dermis o tejido subcutáneo. Puede ser primaria cuando ocurre de novo sin una enfermedad preexistente o secundaria cuando se desarrolla en asociación con una condición subyacente como trauma, enfermedades neoplásicas o inflamatorias. Se observa la presencia de tejido óseo invadiendo la dermis e hipodermis, caracterizado por la presencia de trabéculas óseas. El osteoma cutis puede demostrar osteoblastos, osteoclastos y osteocitos.

La necrosis gástrica puede afectar de forma diferencial a los componentes (mucosa, submucosa, muscular y serosa) del estómago. La necrosis del epitelio de las glándulas gástricas es una condición asociada a patologías infecciosas y no infecciosas. La necrosis de las glándulas gástricas se caracteriza por dilatación del lumen, disminución de la altura del epitelio y pérdida de la estructura del epitelio glandular.

En lo peces el epitelio branquial constituye una barrera física, inmunológica y bioquímica entre el pez y su medio ambiente. Entre las células que componen el epitelio branquial se encuentran las células mucosas. La proliferación de las células mucosas es una de la respuesta inicial de la branquia a irritantes exógenos, lo cual trae como resultado un incremento en el mucus, siendo de esta forma un indicador de la salud branquial.

Los lipomas se definen como tumores mesenquimatosos, que por lo general se ubican por debajo de la piel. Los lipomas están compuestos por tejido adiposo maduro, lobulado, de crecimiento lento, con un mínimo de estroma de tejido conjuntivo. Específicamente la lipomatosis muscular implica el reemplazo de las fibras musculares por tejido adiposo.

Entre los oomycetes patógenos de animales se encuentra las especies pertenecientes al género Saprolegnia sp., que afectan a todas las especies de salmónidos en cultivo en la fase de agua dulce, produciendo impacto en términos de mortalidad, welfare animal, predisposición a infecciones secundarias y calidad de smolt. Los peces afectados se caracterizan por la presencia de lesiones cutáneas tales como erosiones, úlceras y hemorragias, asociadas al crecimiento de micelios que presentan una morfología similar “algodón”, localizados la cabeza, aleta adiposa y aleta caudal. En el caso particular de las ovas se observa un crecimiento de los micelios que puede afectar toda la superficie.

Los melanomas constituyen un tipo de neoplasia de las células denominadas melanocitos (células que producen melanina). La gran mayoría afecta a la piel, aunque también aparecen en las superficies mucosas oral, anogenital, esófago, meninges y ojo. En general los tumores renales son poco frecuentes en peces. Particularmente los melanomas renales en Salmon del Atlántico (Salmo salar), son asociadas a melanosis sistémicas, posiblemente como consecuencia de metástasis primaria a melanomas cutáneos.

Los melanomacrófagos (MM) son células fagocíticas con altas cantidades de melanina, lipofuscina y hemosiderina y están presentes en varias especies de sangre fría, incluido los peces. Los melanomacrófagos desempeñan funciones duales, participando en la respuesta inmune y procesos fisiológicos normales y anormales. La infiltración de melanomacrófagos en el tejido branquial se ha asociado a diferentes patologías. En la fase de agua dulce se asocia a exposición subaguda a crónica a condiciones ambientales desfavorables, en la fase de agua de mar se ha observado asociado a la enfermedad branquial.

La estructura de la piel se encuentra formada por dos capa, la epidermis y dermis. Las escamas son placas acelulares translúcidas de origen dérmico, que se proyectan en la epidermis. Se encuentran compuestas por una matriz mineralizada, localizada en bolsas dérmicas localizadas entre las capas de colágeno del estrato esponjoso y la membrana basal de la epidermis (Bruno et al., 2013). La pérdida de escamas en general se encuentra relacionada con daño mecánico y/o causas infecciosas.

Furunculosis atípica es una infección bacteriana sistémica, causada por Aeromonas salmonicida atípica, la cual ha sido descrita en una amplia variedad de especies de cultivo y se distribuye ampliamente a nivel mundial. Los peces afectados con cuadros agudos a subagudos presentan hemorragias en la base de las aletas, ano hemorrágico e internamente de forma variable es posible observar hemorragias peri renales, hepáticas, vejiga natatoria y grasa peri pilórica. Los cuadros crónicos se caracterizan por la presencia de múltiples erosiones, úlceras, edema hemorrágico del pedúnculo y necrosis muscular.

Una de las manifestaciones de los trastornos metabólicos en las células es la acumulación intracelular de una cantidad anormal de distintas sustancias. El término hialino suele aludir a una alteración dentro de las células o en el espacio extracelular que les da un aspecto homogéneo rosado y vítreo en los cortes rutinarios de histología teñidos con hematoxilina y eosina. Los peces afectados presentan depósitos hialinos intracitoplasmáticos en las células epiteliales de los túbulos renales y de forma variable en el intersticio renal, asociado a degeneración y necrosis.

Los uréteres o conductos arquinéfricos, conducen la orina desde los conductos colectores a la papila urinaria, pueden fusionarse en cualquier nivel y puede dilatarse, después de la fusión, para formar una vejiga. Los conductos urinarios se abren hacia el exterior posterior al ano. Las alteraciones de los uréteres son escasas y en general se relacionan a patología obstructivas.

La fibrosis renal, caracterizada por la fibrosis tubulointersticial y glomeruloesclerosis, corresponde a la manifestación final de la enfermedad renal crónica y se caracteriza por un exceso de depósito de matriz extracelular. En salmónidos la nefropatía obstructiva asociada a nefro calcinosis producto de la exposición crónica a niveles de CO₂ sobre los parámetros considerados como normales, es una de las patologías asociadas a fibrosis renal. 

Las lesiones cutáneas mecánicas producidas durante el procesamiento que afectan la integridad de la piel deben ser consideradas como diagnóstico diferencial de patologías infecciosas y no infecciosas, adicionalmente pueden llegar a constituir una de las causas de degradación de calidad. La abrasión de la piel en superficies puede resultar en erosiones, úlceras y hemorragias.

La miocitólisis focal (también conocida como "degeneración vacuolar" y "miocitólisis colicuativa") del corazón se caracteriza por la vacuolización gradual de las fibras musculares. Se ha sugerido que la lesión produce muerte celular y cicatrización. Esta patología ha sido asociada a enfermedad isquémica agua y crónica, cardiomiopatías, miocarditis, endocarditis entre otras. Particularmente en Salmón del Atlántico (Salmo salar), se ha observado ocasionalmente en peces que cursan cuadros de Inflamación del músculo esquelético y cardiaco (HSMI), no habiendo aun datos suficientes para determinar esta correlación.