Las lesiones producidas por ataques de Lobo de mar común (Otaria flavescens) son variables dependiendo de la interacción mecánica entre la mordedura, pecera y pez. Entre los tipos de lesiones se encuentran pérdida de escamas, erosiones, abrasiones,  contusiones, heridas incisas y por punción. 

La septicemia rickettsial del salmon (SRS), es una infección causada por Piscirickettsia salmonis que afecta a todas las especies de salmónidos cultivados en Chile. Aunque en los últimos años se ha observado una disminución significativa de la frecuencia y severidad de los casos clínicos en el cultivo de Salmón coho (Oncorhynchus kisutch), en las dos últimas temporadas se ha observado un incremento la presentación de casos en esta especie, principalmente en la región de los Lagos.

Durante los meses de verano y otoño 2016 – 2017, se ha observado un incremento significativo en la frecuencia, severidad y ampliación de la distribución geográfica de los casos de amebiasis branquial en centros de Salmon coho (Oncorhynchus kisutch).

Esta condición posiblemente se relaciona con la persistencia de los principales factores de riesgo ambientales como lo son temperatura y salinidad.

La infecciones crónicas causadas por Piscirickettsia salmonis se caracterizan por causar una respuesta inflamatoria granulomatosa en los tejidos.

La miocarditis granulomatosa se caracteriza patológicamente por degeneración, necrosis de las fibras del miocardio y focos de células inflamatorias formando estructuras tipo granuloma, principalmente locaizados en el miocardio esponjoso.

Las larvas de crustáceos pueden incidentalmente afectar el epitelio branquial, siendo la larva zoea uno de los estadios más frecuentemente reportados.

El contacto de las larvas con el epitelio branquial produce una irritación causando  hiperplasia, congestión, telangiectasia y trombosis.

La peritonitis traumática se desarrolla como consecuencia de la ingestión de un cuerpo extraño y posterior perforación del estómago. Entre los signos clínicos se observan gastritis, miocarditis y peritonitis difusa.

La impactación gástrica aguda ha sido descrita en Salmón coho (Oncorhynchus kisutch) y Trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) y en forma esporádica en Salmón del Atlántico (Salmo salar) en la fase de cultivo de engorda en estuario o mar (https://goo.gl/TpKuOf; https://goo.gl/qhf9gE). La incidencia de la impactación gástrica aguda en alevines de Salmón del Atlántico (S. salar) en la fase de cultivo en agua dulce es poco frecuente.

Las patologías oculares en el cultivo de salmónidos son frecuentes y pueden presentarse como una manifestación primaria o secundaria de una enfermedad sistémica. Entre los signos clínicos se encuentran opacidad corneal, exoftalmia, hemorragias, opacidad del cristalino, entre otros.

La impactación gástrica se caracteriza por acumulación excesiva de alimento no digerido en el estómago. Los peces afectados presentan externamente dilatación abdominal e internamente dilatación gástrica producto de la acumulación de alimento.

Los peces rezagados constituyes una de las principales pérdidas productivas en el cultivo de salmónidos, además representan un factor de riesgo para la presentación de enfermedades infecciosas. Macroscópicamente se caracterizan externamente por baja condición y peso significativamente menor al promedio de la población e internamente por ausencia de grasa visceral.

Phaeohyphomicosis es una infección fúngica causada por un grupo heterogéneo de hongos denominados comúnmente como levaduras negras, pertenecientes al género Exophiala spp. (Herpotrichiellaceae, Chaetothyriales), las cuales infectan a numerosas especies de peces de agua dulce y marinos.

Los peces afectados presentan signos clínicos característicos que evidencian una infección crónica, granulomatosa (https://goo.gl/MibUpX). 

Entre las causas de pérdidas directas e indirectas en el cultivo de salmónidos se encuentran las asociadas a la acción de predadores como aves y mamíferos. Las lesiones causadas por aves se caracteriza por ser descamaciones o laceraciones lineales, verticales u oblicuas al eje del pez, de bordes irregulares y simétricas.

La degeneración balonizada es un proceso que resulta de la acumulación de agua, grasa y algunas proteínas que normalmente se excretarían. Morfológicamente se caracteriza por el incremento de tamaño de los hepatocitos y citoplasma pálido.

Este hallazgo es observado en patologías no infecciosas como esteatohepatitis e infecciones virales.

El bazo es uno de los principales órganos linfo mieloides de los salmónidos. Entre sus funciones se encuentran la hematopoyesis y también como órganos de almacenamiento temporal de sangre.

En el bazo pueden manifestarse numerosas enfermedades reactivas y sistémicas, específicamente la inflamación del bazo en general se encuentra asociada a infecciones bacterianas, fúngicas, parasitarias y virales.

La Tenacibaculosis es una infección causada por bacterias pertenecientes al género Tenacibaculum sp. (Familia Flavobacteriaceae, phylum Bacteroidetes).

Entre los signos clínicos macroscópicos se encuentran la presencia de erosión bucal, rostral y de las aletas. Los tejidos infectados presentan film amarillo que corresponde a colonias bacterianas filamentosas. 

Tenacibaculosis es una infecciosa bacteriana causada por bacterias oportunistas pertenecientes al género Tenacibaculum (Familia Flavobacteriaceae, phyum Bacteroidetes). En Salmón del Atlántico (Salmo salar) los cuadros clínicos se caracterizan por erosión de la zona bucal, rostral y de las aletas, asociada a pigmentación amarilla. De forma variable se presentan úlceras únicas o múltiples y erosión branquial asociada a pigmentación amarilla (http://goo.gl/osuTPo; http://goo.gl/k2omOT).

La fibrosis del miocardio es un complejo proceso que involucra todos los componentes celulares del tejido miocárdico, caracterizada por la activación de fibroblastos y  acumulación de matriz extracelular. Entre las causas asociadas a la presentación de fibrosis cardiaca  se encuentran procesos inflamatorios, patologías nutricionales y enfermedades sistémicas metabólicas, entre otros.

La epiteliocistis es una condición infecciosa distribuida mundialmente descrita en numerosas especies de peces de agua dulce y agua de mar, que afecta el epitelio de las branquias y piel, causada por bacterias del orden Clamidiales (Moulder, 1984).

Histológicamente las lesiones se caracterizan por la presencia de hipertrofia de células epiteliales, que son el resultado de la presencia de inclusiones eosinofílicas, correspondientes a micro colonias bacterianas. 

Entre las deformaciones observadas en alevines con saco en salmónidos se encuentran la presentación de siameses, que corresponden a gemelos que siguen unidos después de la eclosión (http://goo.gl/mLrd2g; http://goo.gl/zIZZ7I).

Los siameses pueden ser descritos como asimétricos cuando uno de los alevines no presenta un desarrollo completo o vestigial.