La presentación de la melanosis constituye una de las principales causas de degradación de calidad y pérdida de rendimiento en la planta de proceso.

Morfológicamente los peces afectados pueden presentar lesiones generalmente menores a 3 cm, caracterizadas por una distribución focal, multifocal a difusa, afectando de forma superficial o profunda la musculatura.

Las patologías infecciosas que afectan a la vejiga natatoria son poco frecuentes y la vía de infección se encuentra posiblemente relacionada con ingreso de los patógenos a través del ducto neumático.

La infección por Exophiala salmonis se caracteriza por una proliferación de hifas septadas en el lumen de la vejiga natatoria, asociada de forma variable a inflamación, degeneración y necrosis del tejido.

La falla en la adaptación post transferencia al agua de mar, constituye una de las principales causas de pérdidas en el cultivo de salmón del Atlántico (Salmo salar).

Los peces afectados se caracterizan por presentar un bajo factor de condición, descamación e internamente unos de los signos más característicos es la ausencia de la grasa visceral.

La melanosis corresponde a una hiperpigmentación de los tejidos debido a un incremento del depósito de melanina de localización ectópica.

Entre los factores de riesgo a considerar se encuentran traumatismos osteomusculares, uso de productos farmacológicos por vía intraperitoneal, infecciones bacterianas, parasitarias, virales y de menor frecuencias neoplasias.

La melanosis muscular observada en el cultivo de salmónidos es en general de distribución focal, la melanosis difusa por otro lado es de presentación esporádica.

La enfermedad bacteriana del riñón (BKD) es una patología crónica causada por Renibacterium salmoninarum, la cual afecta a todas las especies de salmónidos cultivados en Chile.

Los peces afectados desarrollan lesiones granulomatosas, la cuales se presentan principalmente en el riñón, hígado y bazo. Histológicamente los granulomas se encuentran formados por macrófagos, leucocitos, detritus celular y bacterias.

La septicemia rickettsial salmononídea es una infección bacteriana causada por Piscirickettsia salmonis, que afecta a todas las especies de salmónidos cultivados en Chile.

Las infecciones crónicas en Salmón coho (Oncorhynchus kisutch) cursan de forma variable con peritonitis.

Una de las principales causas de daño renal agudo es la necrosis tubular aguda (NTA), patología que constituye una de las causas de mortalidades no infecciosas agudas masivas en el cultivo de salmónidos en la fase de agua dulce.

Histológicamente los peces afectados presentan disminución de la altura del epitelio tubular, dilatación tubular, desprendimiento del epitelio tubular y necrosis tubular, entre otros hallazgos.

La gastritis es un término que incluye un amplio espectro de entidades que inducen una respuesta inflamatoria en la mucosa gástrica. En los casos severos los peces afectados presentan erosiones y úlceras multifocales en la mucosa gástrica.

Un granuloma es un foco de inflamación crónica correspondiente a agregaciones microscópicas de macrófagos convertidos en células epitelioides. Ocasionalmente en los granulomas de peces que cursan con cuadros crónicos de Septicemia rickettsial salmonídea (Piscirickettsia salmonis), es posible observar células gigantes que presentan inclusiones eosinofílicas en el citoplasma.

La hiperplasia es un incremento del número de células de un órgano o tejido, que en general determina un aumento de la masa de los mismos.

Es frecuente observar una reacción hiperplásica del epitelio branquial expuestos a agentes infecciosos como bacterias pertenecientes al género Flavobacterium sp. y no infecciosos como condiciones desfavorables de calidad de agua o ambos.

La presentación de tumores en salmónidos no es un hallazgo frecuente, probablemente asociado a que en condiciones de cultivo la sobrevivencia a edades avanzadas de la especie es poco común.

Se describe el caso de un tumor craneal que afecta a un ejemplar de Salmón coho (Oncorhynchus kisutch).

Una de las causas de melanosis muscular corresponde a fracturas de espinas. Los peces afectados presentan un patrón de melanosis lineal, perpendicular al eje de las espinas abdominales.

La miocarditis de células gigantes es una patología poco común, caracterizada por un infiltrado inflamatorio compuesto por células mononucleares y  multinucleadas gigantes, asociado de forma variable a degeneración, necrosis de las células del miocardio sin evidencia de lesiones granulomatosas.

El proceso de la maduración en salmónidos es un fenómeno multifactorial que involucra aspectos genéticos, ambientales y productivos. El término maduración precoz se utiliza para describir aquellos peces que maduran en la fase de agua dulce si haber esmoltificado, afectando principalmente a los machos.

Las lesiones producidas por ataques de Lobo de mar común (Otaria flavescens) son variables dependiendo de la interacción mecánica entre la mordedura, pecera y pez. Entre los tipos de lesiones se encuentran pérdida de escamas, erosiones, abrasiones,  contusiones, heridas incisas y por punción. 

La septicemia rickettsial del salmon (SRS), es una infección causada por Piscirickettsia salmonis que afecta a todas las especies de salmónidos cultivados en Chile. Aunque en los últimos años se ha observado una disminución significativa de la frecuencia y severidad de los casos clínicos en el cultivo de Salmón coho (Oncorhynchus kisutch), en las dos últimas temporadas se ha observado un incremento la presentación de casos en esta especie, principalmente en la región de los Lagos.

Durante los meses de verano y otoño 2016 – 2017, se ha observado un incremento significativo en la frecuencia, severidad y ampliación de la distribución geográfica de los casos de amebiasis branquial en centros de Salmon coho (Oncorhynchus kisutch).

Esta condición posiblemente se relaciona con la persistencia de los principales factores de riesgo ambientales como lo son temperatura y salinidad.

La infecciones crónicas causadas por Piscirickettsia salmonis se caracterizan por causar una respuesta inflamatoria granulomatosa en los tejidos.

La miocarditis granulomatosa se caracteriza patológicamente por degeneración, necrosis de las fibras del miocardio y focos de células inflamatorias formando estructuras tipo granuloma, principalmente locaizados en el miocardio esponjoso.

Las larvas de crustáceos pueden incidentalmente afectar el epitelio branquial, siendo la larva zoea uno de los estadios más frecuentemente reportados.

El contacto de las larvas con el epitelio branquial produce una irritación causando  hiperplasia, congestión, telangiectasia y trombosis.

La peritonitis traumática se desarrolla como consecuencia de la ingestión de un cuerpo extraño y posterior perforación del estómago. Entre los signos clínicos se observan gastritis, miocarditis y peritonitis difusa.